某一天，一颗陨石坠落地球，引发不可思议的时空扭曲。穿越时空隧道出现的，是来自40年后的未来假面骑士波塞冬（浜田賢二饰）。与其它伙伴相比，这是一个好战求胜的战争狂，他发誓要打败所有现代的假面骑士。以此为契机，火野映司（渡部秀饰）、后藤慎太郎（君嶋麻耶饰）和伊达明（岩永洋昭饰）暂时告别普通人生活，挫败波塞冬的野心，并救回失踪良久的Ank（三浦涼介饰）。与此同时，邪恶组织财团X利用陨石带来的宇宙生命之种SOUL展开邪恶计划。为了保卫地球和宇宙，史上最强大的假面骑士部队集结于此……本片为假面骑士系列40周年纪念作品。