剧情的开头是一个叫做Lucheni（湖月わたる）的人在接受审判，质问他为何杀死皇后Elisabeth（花总まり），鲁契尼不承认自己的杀害，并扬言要找出证人来证明自己，于是故事拉开帷幕。少女Sissi（即Elisabeth）不似准备嫁给皇帝的姐姐一般接受淑女教育，而是个非常天真活泼的少女。在年少一次玩闹时，险些丧命。她已经来到了DerTod即死神（姿月あさと）面前，死神却因为被她的容颜深深吸引，发誓要她在活着的时候心甘情愿地爱上他，于是送Sissi回人间。Sissi被母亲带去一同给姐姐相亲，对象是当时奥地利的皇帝FranzJoseph（和央ようか），可皇帝却一眼看中了Sissi，要与Sissi在一起。而两人婚后，生活并不如Sissi所想的那样。失去自由的皇宫、受Franz掌握实权的母亲Sophie（出雲綾）的压迫，甚至失去了教育自己孩子的权利。其间困难重重，死神一次次出现，邀请Sissi和他一同离开，却都被强硬拒绝。Sissi坚持自己只属于自己，不属于任何其他人，并开始学会用美貌来维护国家的利益。中间过程极为复杂，这里就不多说了…后半段里，因为皇帝对自己的背叛，Sissi离开了皇宫，周游各国，不肯回来。Sissi唯一的儿子Rudolf（朝海ひかる）被独自留在了皇宫里。他看到了当时国家的腐败，想要改变，父亲却不听他的话。在死神的怂恿下，他决定起义却失败了。皇帝对他很失望，恰在这时，Sissi在周游各国许多年后终于回来了，Rudolf向她求救，她却因为自己的原因而没有出手帮助儿子。Rudolf最后在父皇的不再信任与母亲的不肯帮助的绝望下，跟随死神的指引，开枪自尽。Sissi得知儿子死后伤心欲绝，死神再次出现，她恳求死神带走她，可死神却再即将亲吻到她时将她推开。他看出Sissi此时还不是真心爱他，于是拒绝了Sissi的要求。后来，Franz也去世了。在地狱里和死神对峙。最后，死神把一把刀交给了Lucheni，于是Lucheni在Sissi一次赶航船的路上刺杀了她。结尾的一幕里，Sissi又变回来她年轻时的样子，不再是皇后Elisabeth。死神也出现了，穿着一袭白衣到她面前。Sissi张开怀抱扑向了死神，在经历了一生的“流泪、欢笑、悲伤、痛苦，在长长的人生道路上，苦苦追寻”后，终于接受了死神这份“即使万物消亡，也永存的你那无尽的爱”。两人一同携手、亲吻、离开。